O SIS-SAP objetiva automatizar procedimentos e integrar informações das Secretarias de Saúde, postos de atendimento e cidadãos em um único banco de dados centralizado e interligado, o que permite maior controle de custos e processos, além de ampliar o acesso do usuário a recursos da Saúde Pública.

O sistema está disponível em formato modular e pode ser implantado de forma gradual, de acordo com as necessidades e características de cada instituição e sua comunidade de usuários. A aquisição por módulos pode reduzir consideravelmente o investimento inicial.